Cuando diecisiete barcos explotan y se hunden cerca de la isla Odo, el profesor Kyohei Yamane, su hija Emiko Yamane y el marino Hideto Ogata se dirigen a la isla para investigar. Pronto son testigos de un monstruo gigante llamado Gojira por los lugareños que destruye el lugar. Mientras tanto, Emiko conoce a su novio, el científico aislado Serizawa, y él le hace prometer que guardará un secreto sobre su investigación con oxígeno. Ella acepta y él revela el arma letal Destructor de oxígeno que había desarrollado. Cuando Gojira amenaza a Tokio y otras ciudades japonesas y el ejército y la marina son incapaces de detener al monstruo, Emiko revela el secreto de Serizawa a su amante Ogata. Ahora quieren convencer a Serizawa de que use el Destructor de oxígeno para detener a Gojira.