Northern Lights presenta a Lyra, una huérfana, que vive en un universo paralelo en el que la ciencia, la teología y la magia están entrelazadas. La búsqueda de Lyra de un amigo secuestrado descubre una siniestra trama que involucra a niños robados, y se convierte en una búsqueda para comprender un misterioso fenómeno llamado Dust